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单片机常用的滤波算法主要有数字滤波算法，包括均值滤波、中值滤波、卡尔曼滤波等，这些滤波算法主要用于消除噪声干扰，提高数据采集的精度，具体选择哪种滤波算法，需要根据实际应用场景和需求来确定。
均值滤波主要用于消除随机噪声，通过计算采样数据的平均值来减少数据的波动。
中值滤波主要用于消除脉冲干扰，适用于去除个别异常数据点。
卡尔曼滤波则是一种高效的递归滤波器，适用于实时处理大量数据，可以在不确定的干扰下估计系统的状态。
至于单片机与滤波器组装机的对比，这主要取决于具体的应用场景和预算，单片机内可以集成数字滤波器，通过编程实现各种滤波算法，具有灵活性高、成本低、易于集成等优点，对于某些特定的应用场合，如需要极高的滤波性能或特定的物理特性，可能需要使用专门的滤波器硬件设备，这些硬件设备可能具有更高的性能和稳定性，但也可能带来更高的成本。
单片机与滤波器组装机哪个更好取决于具体的应用需求，如果需要在成本、灵活性、集成度等方面做出权衡，那么单片机内实现滤波功能可能是一个更好的选择，如果追求更高的性能和特定的物理特性，那么专门的滤波器硬件设备可能更合适。